Das bayerische Verkehrsministerium geht davon aus, dass die Kosten für den Bau der zweiten S-Bahn-Röhre in München von 3,85 auf bis zu 7,2 Milliarden Euro steigen könnten. Zudem könnte sich die Inbetriebnahme der zentralen Strecke durch die Innenstadt von 2028 auf 2037 verzögern.
Die Bahn selbst hat dagegen bisher keine neuen Zahlen oder Details veröffentlicht. Bahn-Chef Richard Lutz Ende Juli sagte nach einem Spitzentreffen unter anderem mit Bayerns Ministerpräsident Markus Söder (CSU) und Münchens Oberbürgermeister Dieter Reiter (SPD) lediglich, «dass es teurer wird und es länger dauern wird».